Los fines u objetivos principales de la Unidad son colaborar y ser intermediario con la Organización Nacional de Trasplantes en todas las actividades relacionadas con la donación y el trasplante de órganos, tejidos y células. Asímismo realizar un registro de los donantes y de los pacientes trasplantados en los hospitales de la autonomía participando en la Coordinación intrahospitalaria e interhospitalaria de los procesos de donación y trasplante realizadas en los hospitales de Castilla-La Mancha